目的了解海南省2023年1型登革病毒(dengue virus type 1,DENV-1)包膜蛋白(envelope,E)基因特征,为当地登革热防治提供参考。方法通过海南省登革热监测系统收集2023年登革热疑似病例血清样本。采用实时荧光定量PCR(real-time PCR,RT-PCR...目的了解海南省2023年1型登革病毒(dengue virus type 1,DENV-1)包膜蛋白(envelope,E)基因特征,为当地登革热防治提供参考。方法通过海南省登革热监测系统收集2023年登革热疑似病例血清样本。采用实时荧光定量PCR(real-time PCR,RT-PCR)方法检测登革病毒核酸及其型别,再对核酸阳性样本进行基因组序列测定,进一步通过构建进化树对E基因序列进行同源性分析及编码蛋白氨基酸位点差异分析。结果从49份DENV-1型阳性样本中获得38条E蛋白基因序列。进化分析显示,38条DENV-1型E基因序列间核苷酸(氨基酸)同源性为98.5%~100.0%(98.4%~100.0%);同Hawaii参考株(AF425619.1/USA:Hawaii/1945)相比,核苷酸(氨基酸)同源性为93.5%~94.3%(96.0%~97.0%)。38条DENV-1型E基因序列均属于Ⅰ基因型,其中37条基因序列聚为1小支,与2019年缅甸和2023年中国广州参考序列有较近的遗传关系;另外1条E基因序列与2019年中国海南省DENV-1流行株、新加坡参考序列、柬埔寨参考序列以及2021年中国海南海口参考序列遗传关系较近。同Hawaii株相比,E蛋白495个氨基酸位点中存在27个氨基酸位点变异,但3个重要毒力位点E44(E)、E156(T)、E366(N)和2个糖基化位点(第67位与153位)未发生突变。结论2023年海南省DENV-1属于Ⅰ基因型,流行可能涉及2条传播链。病毒毒力和糖基化位点均未发生变化,但E蛋白存在多个变异位点;提示病毒在进化过程中可能受到选择压力的影响,建议今后持续加强登革热病原学监测,采取更加有效的防控措施。展开更多
文摘目的了解海南省2023年1型登革病毒(dengue virus type 1,DENV-1)包膜蛋白(envelope,E)基因特征,为当地登革热防治提供参考。方法通过海南省登革热监测系统收集2023年登革热疑似病例血清样本。采用实时荧光定量PCR(real-time PCR,RT-PCR)方法检测登革病毒核酸及其型别,再对核酸阳性样本进行基因组序列测定,进一步通过构建进化树对E基因序列进行同源性分析及编码蛋白氨基酸位点差异分析。结果从49份DENV-1型阳性样本中获得38条E蛋白基因序列。进化分析显示,38条DENV-1型E基因序列间核苷酸(氨基酸)同源性为98.5%~100.0%(98.4%~100.0%);同Hawaii参考株(AF425619.1/USA:Hawaii/1945)相比,核苷酸(氨基酸)同源性为93.5%~94.3%(96.0%~97.0%)。38条DENV-1型E基因序列均属于Ⅰ基因型,其中37条基因序列聚为1小支,与2019年缅甸和2023年中国广州参考序列有较近的遗传关系;另外1条E基因序列与2019年中国海南省DENV-1流行株、新加坡参考序列、柬埔寨参考序列以及2021年中国海南海口参考序列遗传关系较近。同Hawaii株相比,E蛋白495个氨基酸位点中存在27个氨基酸位点变异,但3个重要毒力位点E44(E)、E156(T)、E366(N)和2个糖基化位点(第67位与153位)未发生突变。结论2023年海南省DENV-1属于Ⅰ基因型,流行可能涉及2条传播链。病毒毒力和糖基化位点均未发生变化,但E蛋白存在多个变异位点;提示病毒在进化过程中可能受到选择压力的影响,建议今后持续加强登革热病原学监测,采取更加有效的防控措施。
