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基于流形学习的基因表达谱数据可视化
被引量:
8
1
作者
肖传乐
曹槐
《生物信息学》
2009年第1期47-51,共5页
基因表达谱的可视化本质上是高维数据的降维问题。采用流形学习算法来解决基因表达谱的降维数据可视化,讨论了典型的流形学习算法(Isomap和LLE)在表达谱降维中的适用性。通过类内/类间距离定量评价数据降维的效果,对两个典型基因芯片数...
基因表达谱的可视化本质上是高维数据的降维问题。采用流形学习算法来解决基因表达谱的降维数据可视化,讨论了典型的流形学习算法(Isomap和LLE)在表达谱降维中的适用性。通过类内/类间距离定量评价数据降维的效果,对两个典型基因芯片数据集(结肠癌基因表达谱数据集和急性白血病基因表达谱数据集)进行降维分析,发现两个数据集的本征维数都低于3,因而可以用流形学习方法在低维投影空间中进行可视化。与传统的降维方法(如PCA和MDS)的投影结果作比较,显示Isomap流形学习方法有更好的可视化效果。
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关键词
基因芯片
流形学习
数据降维可视化
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职称材料
特色生物实验室教学与管理改革探讨
被引量:
3
2
作者
贾红玲
洪嫄
+1 位作者
银兴峰
肖传乐
《山西医科大学学报(基础医学教育版)》
2010年第5期521-523,526,共4页
生物实验室是师生进行科学实验和教学活动的重要场所,是完成生物教学任务不可缺少的组成部分。根据生物学科发展特点,结合蛋白组学专业特色,对实验室教学和管理改革进行了探索与实践,为培养具有科研能力与创新精神的高素质人才打下坚实...
生物实验室是师生进行科学实验和教学活动的重要场所,是完成生物教学任务不可缺少的组成部分。根据生物学科发展特点,结合蛋白组学专业特色,对实验室教学和管理改革进行了探索与实践,为培养具有科研能力与创新精神的高素质人才打下坚实的基础。
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关键词
生物实验室
教学改革
创新
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职称材料
免疫相关高致盲眼病精准诊疗体系的建立与应用
3
作者
无
迟玮
+13 位作者
肖传乐
谢志
王宁利
卓业鸿
文峰
钟嘉泳
邵毅
戴烨
胡译心
牛龙见
陈颖
蒋丽琼
苏丽施
叶晓圆
《中国科技成果》
2025年第23期57-60,共4页
致盲眼病、肿瘤和心血管疾病是严重影响人类生存质量的三大疾病。免疫相关高致盲眼病是最主要的致盲原因之一,包括葡萄膜炎、年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变等临床常见的重要不可逆致盲眼病。目前,免疫相关高致盲眼病的诊疗模式...
致盲眼病、肿瘤和心血管疾病是严重影响人类生存质量的三大疾病。免疫相关高致盲眼病是最主要的致盲原因之一,包括葡萄膜炎、年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变等临床常见的重要不可逆致盲眼病。目前,免疫相关高致盲眼病的诊疗模式存在早期诊断率低、发病机制不清且治疗靶点不明确三大瓶颈。
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关键词
葡萄膜炎
精准诊疗
免疫相关
高致盲眼病
暂未订购
题名
基于流形学习的基因表达谱数据可视化
被引量:
8
1
作者
肖传乐
曹槐
机构
云南大学物理系非线性复杂系统中心
云南大学现代生物学研究中心
出处
《生物信息学》
2009年第1期47-51,共5页
文摘
基因表达谱的可视化本质上是高维数据的降维问题。采用流形学习算法来解决基因表达谱的降维数据可视化,讨论了典型的流形学习算法(Isomap和LLE)在表达谱降维中的适用性。通过类内/类间距离定量评价数据降维的效果,对两个典型基因芯片数据集(结肠癌基因表达谱数据集和急性白血病基因表达谱数据集)进行降维分析,发现两个数据集的本征维数都低于3,因而可以用流形学习方法在低维投影空间中进行可视化。与传统的降维方法(如PCA和MDS)的投影结果作比较,显示Isomap流形学习方法有更好的可视化效果。
关键词
基因芯片
流形学习
数据降维可视化
Keywords
gene expression profile
manifold learning
reduction and visualization of data
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
特色生物实验室教学与管理改革探讨
被引量:
3
2
作者
贾红玲
洪嫄
银兴峰
肖传乐
机构
暨南大学生命与健康工程研究院
广东省东莞市出入境检验检疫局综合技术中心
出处
《山西医科大学学报(基础医学教育版)》
2010年第5期521-523,526,共4页
文摘
生物实验室是师生进行科学实验和教学活动的重要场所,是完成生物教学任务不可缺少的组成部分。根据生物学科发展特点,结合蛋白组学专业特色,对实验室教学和管理改革进行了探索与实践,为培养具有科研能力与创新精神的高素质人才打下坚实的基础。
关键词
生物实验室
教学改革
创新
Keywords
biology laboratory
teaching reform
innovation
分类号
R197.21 [医药卫生—卫生事业管理]
G642.0 [文化科学—高等教育学]
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职称材料
题名
免疫相关高致盲眼病精准诊疗体系的建立与应用
3
作者
无
迟玮
肖传乐
谢志
王宁利
卓业鸿
文峰
钟嘉泳
邵毅
戴烨
胡译心
牛龙见
陈颖
蒋丽琼
苏丽施
叶晓圆
机构
深圳市眼科医院
美国贝勒医学院
深圳市眼科医院(南方医科大学深圳眼科医学中心)
不详
出处
《中国科技成果》
2025年第23期57-60,共4页
文摘
致盲眼病、肿瘤和心血管疾病是严重影响人类生存质量的三大疾病。免疫相关高致盲眼病是最主要的致盲原因之一,包括葡萄膜炎、年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变等临床常见的重要不可逆致盲眼病。目前,免疫相关高致盲眼病的诊疗模式存在早期诊断率低、发病机制不清且治疗靶点不明确三大瓶颈。
关键词
葡萄膜炎
精准诊疗
免疫相关
高致盲眼病
分类号
R77 [医药卫生—眼科]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于流形学习的基因表达谱数据可视化
肖传乐
曹槐
《生物信息学》
2009
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
特色生物实验室教学与管理改革探讨
贾红玲
洪嫄
银兴峰
肖传乐
《山西医科大学学报(基础医学教育版)》
2010
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
免疫相关高致盲眼病精准诊疗体系的建立与应用
无
迟玮
肖传乐
谢志
王宁利
卓业鸿
文峰
钟嘉泳
邵毅
戴烨
胡译心
牛龙见
陈颖
蒋丽琼
苏丽施
叶晓圆
《中国科技成果》
2025
0
暂未订购
已选择
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