目的:通过网络药理学及分子对接,分析青蒿素抗膀胱癌潜在的分子机制。方法:利用TCMSP、HERB及SwissTargetPrediction数据库检索青蒿素的相关靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGKB等数据库检索膀胱癌的相关靶点。取交集得到青蒿素抗膀胱...目的:通过网络药理学及分子对接,分析青蒿素抗膀胱癌潜在的分子机制。方法:利用TCMSP、HERB及SwissTargetPrediction数据库检索青蒿素的相关靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGKB等数据库检索膀胱癌的相关靶点。取交集得到青蒿素抗膀胱癌的潜在作用靶点。通过构建PPI网络、GO和KEGG富集分析筛选核心靶点基因、生物过程及其信号通路。利用GEPIA2、HPA及TIMER数据库分析核心靶点的表达差异及肿瘤免疫浸润。通过AutoDock Tools及PyMol对青蒿素与核心靶点进行分子对接,预测其结合活性。结果:共筛选出青蒿素抗膀胱癌的潜在作用靶点86个,核心靶点基因为细胞周期蛋白B1(Cyclin-B 1,CCNB1)、细胞周期蛋白A2(Cyclin-A 2,CCNA2)、细胞周期依赖性激酶2(Cyclin-Dependent Kinase 2,CDK2)。GO富集分析生物过程主要涉及蛋白质磷酸化、细胞增殖的正调控以及对外源刺激和代谢过程;细胞组分主要涉及与细胞周期调控和突触功能相关的成分;分子功能主要涉及与酶结合、激酶活性、底物结合及氧化还原反应。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析主要涉及癌症相关通路、病毒感染、信号转导通路、细胞分化及代谢过程等。核心靶点的差异表达分析结果显示其在肿瘤组织中表达升高,肿瘤免疫浸润结果表明其与CD8阳性T细胞(Cluster of Differentiation 8-Positive T Cell,CD8^(+)T Cell)呈正相关,与CD4阳性T细胞(Cluster of Differentiation 4-Positive T Cell,CD4^(+)T Cell)呈负相关。分子对接结果显示,青蒿素与其核心靶点蛋白均具有较好的结合活性。结论:通过网络药理学及分子对接预测了青蒿素可能通过多靶点、多途径抗膀胱癌,为其更为深入的研究提供理论依据。展开更多
文摘目的:通过网络药理学及分子对接,分析青蒿素抗膀胱癌潜在的分子机制。方法:利用TCMSP、HERB及SwissTargetPrediction数据库检索青蒿素的相关靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGKB等数据库检索膀胱癌的相关靶点。取交集得到青蒿素抗膀胱癌的潜在作用靶点。通过构建PPI网络、GO和KEGG富集分析筛选核心靶点基因、生物过程及其信号通路。利用GEPIA2、HPA及TIMER数据库分析核心靶点的表达差异及肿瘤免疫浸润。通过AutoDock Tools及PyMol对青蒿素与核心靶点进行分子对接,预测其结合活性。结果:共筛选出青蒿素抗膀胱癌的潜在作用靶点86个,核心靶点基因为细胞周期蛋白B1(Cyclin-B 1,CCNB1)、细胞周期蛋白A2(Cyclin-A 2,CCNA2)、细胞周期依赖性激酶2(Cyclin-Dependent Kinase 2,CDK2)。GO富集分析生物过程主要涉及蛋白质磷酸化、细胞增殖的正调控以及对外源刺激和代谢过程;细胞组分主要涉及与细胞周期调控和突触功能相关的成分;分子功能主要涉及与酶结合、激酶活性、底物结合及氧化还原反应。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析主要涉及癌症相关通路、病毒感染、信号转导通路、细胞分化及代谢过程等。核心靶点的差异表达分析结果显示其在肿瘤组织中表达升高,肿瘤免疫浸润结果表明其与CD8阳性T细胞(Cluster of Differentiation 8-Positive T Cell,CD8^(+)T Cell)呈正相关,与CD4阳性T细胞(Cluster of Differentiation 4-Positive T Cell,CD4^(+)T Cell)呈负相关。分子对接结果显示,青蒿素与其核心靶点蛋白均具有较好的结合活性。结论:通过网络药理学及分子对接预测了青蒿素可能通过多靶点、多途径抗膀胱癌,为其更为深入的研究提供理论依据。
