旨在鉴定与大别山牛体重和体尺性状相关的分子标记位点与候选基因,以深入探究其遗传机制。本研究选取30~36月龄的515头健康大别山牛开展体重、十字部高、体斜长、胸围、腹围、管围、坐骨端宽及腰角宽8个性状指标表型测定。基于纽勤100K...旨在鉴定与大别山牛体重和体尺性状相关的分子标记位点与候选基因,以深入探究其遗传机制。本研究选取30~36月龄的515头健康大别山牛开展体重、十字部高、体斜长、胸围、腹围、管围、坐骨端宽及腰角宽8个性状指标表型测定。基于纽勤100K芯片对515头大别山牛进行基因分型,利用混合线性模型(mixed linear model,MLM)开展全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)。结果发现44个SNPs位点与体重和体尺性状显著相关,注释到426个候选基因。其中,重点关注了6个与肌肉发育、软骨生成及骨代谢过程相关的候选基因(WFIKKN2、MMP2、MATN1、PUM1、VKORC1和VKORC1L1)。GO和KEGG功能富集分析进一步表明,VKORC1和VKORC1L1基因参与维生素K代谢等关键生物学过程,有待进一步挖掘。综上,本研究结果可为大别山牛品种改良提供明确的分子靶点和重要参考。展开更多
文摘旨在鉴定与大别山牛体重和体尺性状相关的分子标记位点与候选基因,以深入探究其遗传机制。本研究选取30~36月龄的515头健康大别山牛开展体重、十字部高、体斜长、胸围、腹围、管围、坐骨端宽及腰角宽8个性状指标表型测定。基于纽勤100K芯片对515头大别山牛进行基因分型,利用混合线性模型(mixed linear model,MLM)开展全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)。结果发现44个SNPs位点与体重和体尺性状显著相关,注释到426个候选基因。其中,重点关注了6个与肌肉发育、软骨生成及骨代谢过程相关的候选基因(WFIKKN2、MMP2、MATN1、PUM1、VKORC1和VKORC1L1)。GO和KEGG功能富集分析进一步表明,VKORC1和VKORC1L1基因参与维生素K代谢等关键生物学过程,有待进一步挖掘。综上,本研究结果可为大别山牛品种改良提供明确的分子靶点和重要参考。
