文摘目的运用生物信息学分析方法分析原发性硬化性胆管炎(Primary Sclerosing Cholangitis,PSC)与骨质疏松症(Osteoporosis,OP)之间的关联及潜在治疗靶点。方法通过GEO数据库下载PSC和OP基因表达数据,筛选差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs);运用R软件包进行京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;结合蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络筛选的枢纽基因进而确定PSC和OP关键基因;进行基因集富集(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)分析和免疫相关因素分析;通过DSigDB数据库预测潜在的药物治疗靶点。结果共筛选出30个DEGs,通路富集分析显示DEGs主要富集于NF-κB信号通路。PPI与模块基因结合筛选出5个关键基因,分别为TLR4、BCL2L1、ADIPOR1、BSG和BCL6;GSEA分析和免疫相关因素分析结果显示PSC与OP可能与免疫和代谢有相关性;通过DSigDB数据库预测潜在的药物治疗靶点。结论PSC与OP之间可能存在较为显著的关系,TLR4、BCL2L1、ADIPOR1、BSG和BCL6在PSC和OP中发挥重要作用,劳拉西泮(lorazepam)、链脲佐菌素(streptozocin)和环磷酰胺(cyclophosphamide)可能作为潜在治疗药物。
