摘要
PLATZ家族是一类广泛分布于植物中的特异性锌指转录因子,在植物生长发育及逆境响应中发挥重要作用。为探究花苜蓿PLATZ基因的特征及其作用机制和表达模式,采用多种生物信息学分析工具(包括TBtools中的本地BLAST、Hmm search等功能及在线Batch CD-Search网站),通过Protein Pairwise Similarity Matrix分析MruPLATZ蛋白的理化性质,并利用MEGA 11.0软件构建系统进化树。同时,还通过MEME和Plant CARE在线平台分析PLATZ转录因子的基因结构和保守基序,并对基因上游的顺式作用元件进行预测。复制事件分析则通过TBtools中的One Step MCScanX和MCScanX功能进行。结果表明,花苜蓿中共鉴定出20个MruPLATZ基因,分布在6条染色体上。系统进化分析将MruPLATZ家族成员分为5类,不同类别的蛋白质具有不同的motif种类和排列顺序。共线性分析发现MruPLATZ家族内存在6个重复事件,其中包括4对片段重复和2组串联重复。与拟南芥、蒺藜苜蓿、紫花苜蓿相比,花苜蓿PLATZ家族与大豆PLATZ家族具有较为接近的同源关系。启动子顺式作用元件分析结果显示,每个基因都包含干旱响应元件或与干旱相关的激素响应元件。表达模式分析及实时荧光定量qRT-PCR验证结果初步表明,MruPLATZ02、MruPLATZ03、MruPLATZ07、MruPLATZ15和MruPLATZ18基因在干旱响应过程中起到正向调节作用,而MruPLATZ01、MruPLATZ11、MruPLATZ17和MruPLATZ19基因则表现出负向调控作用。本研究系统探讨了MruPLATZ基因的理化性质和表达模式,为花苜蓿抗旱分子育种提供了理论依据和潜在靶标。
出处
《江苏农业科学》
2025年第24期94-104,共11页
Jiangsu Agricultural Sciences
基金
内蒙古自治区“揭榜挂帅”项目(编号:2022JBGS0040)
2023年国家草业技术创新中心(筹)重大创新平台建设专项(编号:CCPTZX2023N04)
国家现代农业产业技术体系资助项目(编号:CARS-34)。
